对于肛瘘疾病手术后复发率的报道，多少不一，有的文献报道肛瘘的复发率为10%，而有的报道仅为1%。调查肛瘘手术后复发的原因，95%以上是因为没有准确的找到内口，或没有把感染的原发病灶，感染的肛窦、肛门腺
1肛瘘疾病之所以会复发的原因
对于肛瘘疾病手术后复发率的报道，多少不一，有的文献报道肛瘘的复发率为10%，而有的报道仅为1%。调查肛瘘手术后复发的原因，95%以上是因为没有准确的找到内口，或没有把感染的原发病灶，感染的肛窦、肛门腺导管和肛门腺以及瘘管的支管、空腔完全彻底清除干净，因为祸根没有除掉，所以才会复发，所谓隐患除之务净，不尽则终将为害也。
复发的原因主要是：①没有正确找到或处理好内口;②患者未遵医嘱按期来医院复诊导致创面桥形愈合，引流不畅，导致复发;③瘘管壁及瘘管内组织处理不彻底。其中最主要的原因是第1和第2点，一是因为有的肛瘘有多个内口或位置太高探查有偏差，处理不彻底，二是因为肛瘘手术一般都是不住院的，有的病人没有意识到术后换药的重要性，有的病人是因为工作忙碌走不开，也有的病人是因为路途遥远不方便，因此没有按要求来医院复诊换药导致复发。
由上可知，肛瘘手术后又出现复发的现象是确实可能存在的，这与患者的病情、手术医生的技术水平及术后换药等均有直接密切关系，一般来说，出现复发的几率是很低的，患者应该放心的尽早去接受手术为好，当然，还是那句老话，最好找正规医院的肛肠专科医生，这样您的手术才会得到好的保障。
所以肛瘘疾病手术时要准确找到原发内口，不是一件很容易的事，特别是内口有二个以上，位置较高的高位复杂性肛瘘，就更困难了，万一找不到内口，或在找寻中，人为的用探针捅出了一个内口，手术后就会出现伤口不愈合，或再次出现肛瘘不时破溃流脓的情况。
2高位肛瘘疾病之所以难治的原因
肛瘘疾病本身就是一个非常麻烦的疾病，而高位肛瘘、复杂性肛瘘一直被认为是外科难治性疾病，疗程中很多不确定的因素会影响到治愈率，复发可能大。
实际上，对瘘道的分布、与括约肌的关系等问题牵扯到一个复杂的诊治过程，探针、指诊的检查对棘手的高位复杂性肛瘘来说还远远不够，病灶的造影、超声检查有助于了解病灶内部，有时能帮助诊断瘘道的走向分布，每一例个性化手术方案的必要条件是：既能清除掉病人的所有瘘管，又不损伤病人的肛门自制功能，因为即使肛瘘治好了，肛门也失禁了是病人不能接受的事，这才是根本的难处。
目前临床应用的高位复杂性肛瘘的治疗方法，实际上是一个综合的疗法，把中医传统的挂线疗法的优势保存下来，针对不足的一面，运用手术方法弥补。临床上与复杂性肛瘘的治疗同样困难的另一种情形是肛门直肠周围脓肿，尤其是高位脓肿，同样不能引起患者的重视，病人常认为输点水就能像身体其他部位的ji肿那样轻易消失掉。事实情况是单纯的切开引流等外科措施远不能解决问题，90%以上的直肠周围多间隙感染的病人最终会发展成肛瘘或是高位复杂性肛瘘，病人需要忍受接下来数次手术的痛苦，一些外科的医生宁愿给病人大剂量的抗生素而不愿意轻易做这样的切开，因为一切开就会漏。针对患者对疾病的不了解，医生在治疗过程中需要做很多的解释才能让他对自身疾病的发展转归有一个清晰的认识，但是专科医生认为及早治疗和干预仍然非常必要。
临床开展的高位脓肿、高位复杂性肛瘘的一期治疗实际上是努力把需要两次三次手术的治疗过程尽可能一期完成，这样可以大大缩短整个疗程，减少痛苦。即使这样，任何专科的医生仍会实事求是地告诉你没有100%成功的把握。术中术后的处理力争把复发率降到最低，这是每一例高位脓肿和复杂性肛瘘的治疗目标。
所以对于肛瘘疾病，如果一旦发现首先就是要积极的做一个检查，明确症状，因为发生肛瘘的原因多种多样，还有些是由于肛周脓肿手术后产生的，所以明确症状再诊断是非常重要的。
3肛瘘疾病治疗不当会引起肛门失禁
我们知道肛瘘疾病本身就是发生在肛门周围，而肛瘘疾病的治疗只有进行手术治疗才有可能治愈。而只要是进行手术就存在着风险。肛瘘疾病治疗不当会引起肛门失禁。
肛门的括约功能是由肛门外括约肌、肛提肌和肛门内括约肌共同完成的。而肛门外括约肌一般又可分为三层，即肛门外括约肌皮下层、肛门外括约肌浅层和肛门外括约肌深层。
临床上，切断外括约肌皮下层和浅层，一般不会影响人的排便。但如果切断肛门外括约肌深层，以及肛提肌的耻骨直肠肌及内括约肌，就会使肛门松弛，失去对肛门的控制，造成大便失禁、直肠脱出等不良后果。
而高位肛瘘，特别是肛提肌以上的高位肛瘘，不切断肛提肌则很难清除病灶，使肛瘘彻底治愈。因此，对于高位肛瘘的治疗是非常复杂而且困难的，为此，国内外临床医生做了大量的工作，设计了许多手术方法，但这些方法总是存在一些较大的缺陷。而中医挂线疗法，对高位肛瘘的治疗较为完善。
对于肛瘘疾病来说其本身就是肛肠疾病的一种，其也是由肛周脓肿发病而来。所以只有进行手术才有可能治愈。那么在手术过程当中就要特别注意，如果治疗不彻底就有可能引起肛门功能失禁。
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