自2002年9月至底，全国以各级疾控中心基本建设为主的疾病预防控制体系建设项目共2416个，总投资105亿元，已基本完成；全国以传染病院（区）、医疗急救中心为主的突发公共卫生事件医疗救治体系建设项目2649个，总投资164亿元，进展比较顺利。同时，省级疾病预防控制机构和卫生监督执法机构改革全部完成，市（地）级改革大部分完成，县（区）级改革部分完成，具有中国特色的疾病预防控制体系基本形成。
自1月起，全国正式启动以传染病个案报告为基础的疫情网络直报系统，全国内地31个省份通过网络报告传染病疫情，提高了疫情报告的及时性、敏感性和准确性，实现了传染病和突发公共卫生事件监测的动态统计和分析，疾病预防控制和传染病监测工作的水平有了明显提高。卫生部和部分省份实行了疫情信息定期发布制度，为满足公众的知情需求，引导舆论，增强人民群众的防病意识，控制传染病疫情起到了很好地促进作用。公共卫生体系建设的效果已经显现，突发公共卫生事件的应急处置能力有了很大提高，在处置非典、人感染高致病性禽流感等突发公共卫生事件中经受住了实践的考验。
当前，各地正在按照《关于疾病预防控制体系建设的若干规定》和《关于卫生监督体系建设的若干规定》，进一步明确疾病预防控制机构和卫生监督机构的功能定位，加强人员培训和人才队伍建设，在继续完善公共卫生体系建设的基础上，重点提高疾病预防控制体系和应急医疗救治体系的总体服务能力和保障能力；适应疾病预防控制任务的需要，完善疾病预防控制机构的服务模式；通过落实责任、完善运行机制、加强能力建设和保障经费等措施，进一步推进疾病预防控制体制建设和改革；健全突发公共卫生事件应急机制，完善重大传染病疫情和突发公共卫生事件监测系统、医疗救治信息系统和应急指挥系统；继续协调有关部门对重大疾病和公共卫生实施防控和干预，防止和控制疾病的发生与蔓延，做好有效应对新发传染病的充分准备，努力提高公共卫生体系保障人民群众健康的综合能力。
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