对于新型农村合作医大病报销，其报销比例根据不同医院等级，其报销比例会有所不同。除了发生超过基本医疗统筹基金最高支付限额以上的医疗费用，按照不同范围的医疗费用，其报销比例会有所不同。一般医疗费用花费在0—4万元以下的可以报销85％医疗费用在4万—8万元以下的可以报销90％医疗费用在8万元以上的可以报销95％，并且在每一个医疗年度内，最高支付的限额为15万元。其中，在不同医疗机构其报销比例分别为：
１、门诊统筹乡、村补助比例分别提高到了65％、75％。
２、在一级医疗机构住院费用在400元以下者，是不设有起付线标准的。在二级医疗机构补助的比例将会提高到75％—80％在三级医院机构住院费用补助的比例可以提高到55％—60％在省三级医疗机构住院费用，所补助的比例会提高到55％。
３、儿童先天性心脏病、儿童白血病、儿童苯丙酮尿症等8种大病，新农合的补助病种定额的比例为70％肺癌、食道癌、宫颈癌等12种大病，新农合的补助病种定额的比例将会达到70％。
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