不会。
医保卡的余额每年是不会清零的。目前，我国主要有职工医保和城乡居民医保，两种制度对于个人账户的设计是不一样的。
其中，职工医保有两个账户，包括统筹账户和个人账户，是有个人账户的。而城乡居民医保只有一个账户，就是统筹账户，是没有设立个人账户的，之前个别地区在试点新农保时设立有个人账户的，到底也全部取消了。
所以，这里说的医保余额，其实指的是职工医保个人账户的余额。城乡居民医保没有个人账户，自然就不涉及到清零与否的问题，因此，参保人员不要混淆了。而职工医保的个人账户，里面的钱属于参保人员个人财产，包括社保机构等任何部门没有权利清零参保人员的个人账户。
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