一、巧克力囊肿应首选手术治疗
首先，手术和药物治疗相比，清除病灶比较彻底、复发的可能性低。目前，针对巧克力囊肿还没有特效的药物，常见的是服用口服避孕药或抗雌激素治疗。但一般停药常常复发，而因为药物副作用的原因，很多患者服用半年就得停药。
其次，手术和超声介入穿刺治疗相比，虽然介入穿刺治疗创伤更小，但治疗效果不彻底，容易复发。介入穿刺治疗简单说就是将巧克力囊肿内的物质抽吸出来，但囊肿还在那里。因此，复发几率是比较高的。另外介入穿刺治疗无法进行病理学诊断，不能准确判断囊肿的性质。所以，初次治疗的患者，不建议选择介入穿刺治疗。只有手术后出现复发，再次手术的风险比较大或不能耐受的患者，可以考虑介入穿刺治疗。
那么手术如何治疗巧克力囊肿？目前施行最多的有囊肿剥除术和患侧卵巢切除术两种方式。具体如何选择，还要根据囊肿的大小、患者的年龄与生育需求来评估。对于年龄较轻，并且有生育要求的女性，我们多选择囊肿剥除术，将囊肿从卵巢上剥离下来，从而最大限度地保留正常的卵巢组织，尽量不影响生育功能。但因为巧克力囊肿的发生和人体内雌激素的水平有关，所以虽然保留了卵巢功能，同时也意味着巧克力囊肿是可能复发的。如果患者年龄较大，没有生育要求，或患者盆腔内附件粘连严重、囊肿过大，难以剥除，这时就要考虑患侧卵巢切除术。该手术在切除了一侧或双侧卵巢后，复发几率比单纯剥除囊肿要小很多。需要指出的是，一侧卵巢切除后，并不能防止另一侧卵巢发生巧克力囊肿。
目前两类手术大多可以通过腹腔镜来进行，较之传统的开腹手术创伤小、恢复快。所以不用过分担心手术范围和术后恢复的问题。当然，对于一些粘连严重、囊肿巨大、甚至怀疑有恶变可能的患者，开腹手术可能更加合适。
二、巧克力囊肿要做哪些检查
1.病史
重点询问月经史、孕产史、家族史及手术史。特别注意疼痛或痛经的发生发展与月经和剖宫产、人流术、输卵管通液术等手术的关系。
2.妇科检查
除双合诊外，应特别强调必须进行三合诊检查。卵巢子宫内膜异位症者，在附件区可触及与子宫或阔韧带、盆壁相粘连的囊性肿块，活动度差，往往有轻度触痛，囊肿直径一般小于10cm。
3.腹腔镜检查
腹腔镜检查是目前临床上诊断卵巢巧克力囊肿效果最好的方法，主要是在腹腔镜的辅助下对盆腔进行窥视，能够精确的找到子宫内膜异位的位置以及病因，并且对其进行精确的诊断。
4.其他辅助检
（1）影像学检查 阴道和腹部B型超声检查是鉴别卵巢子宫内膜异位囊肿的重要手段，其诊断敏感性和特异性均在96%以上。B型超声检查可确定卵巢子宫内膜异位囊肿的位置、大小、形状和囊内容物，与周围脏器特别是与子宫的关系等。超声图像一般显示囊肿呈椭圆形、圆形，囊肿可为单房或多房，与周围组织特别是与子宫有粘连，囊肿壁较厚且粗糙，囊内有点状细小的絮状光点。囊肿大小可随月经周期出现一定的变化。由于囊肿的回声图像无特异性，不能单纯根据超声图像确诊。盆腔CT及MRI对盆腔内异症的诊断价值与B型超声相当，但费用较昂贵。MRI对卵巢内膜异位囊肿的诊断和评估有意义。
（2）血清CA125测定 中、重度内异症患者血清CA125值可能会升高，但一般均为轻度升高，多低于100IU/L。但CA125的特异性和敏感性均局限，且与多种疾病有交叉阳性反应，因此不能单独用做诊断或鉴别诊断。对于CA125值升高者，血清CA125水平可用于监测异位内膜病变活动情况，治疗有效时降低，复发时义升高。
三、卵巢巧克力囊肿的发病原因
一、内分泌因素：该因素是常见的卵巢囊肿的病因，卵巢虽小，却是产生卵子并排卵、内分泌激素、平衡内分泌的重要器官，多发生于内分泌旺盛的生育年龄。所以认为与内分泌失调有关。另外，来例假时生气，一生气例假就没了，造成垃圾排不出来，在卵巢里形成了囊肿。
二、分娩、多次流产等：巧克力囊肿主要是由于月经期子宫壁脱落的子宫内膜碎片因引流不畅，不能全部从阴道排出，有少量经输卵管向盆腔倒流。凡是能影响月经血从阴道流出的，包括阴道闭锁、子宫颈口狭小、子宫后倾、多次人工流产后子宫颈口粘连、月经期性生活等，都能促发生巧克力囊肿。
三、输卵管阻塞：每月卵巢内没有受精的卵泡成为废品垃圾也要排泄出去，必须靠体内液压把这些垃圾挤出来，由于你机能减退，加上输卵管有堵塞现象，垃圾排不出来，排不出去的卵子堆积在卵巢内，就形成了巧克力囊肿。四、性生活频繁：性生活频繁也是导致卵巢巧克力囊肿的重要原因，一般发病多在青春期少女或更期妇女，这与她们频繁性生活有很大关系。
五、生理原因：女性的子宫内膜在正常的情况下面是在宫腔之中生长的，随着每个月女性生理期的到来，其会剥落之后重新开始增厚生长。但是由于内膜开始在女性的卵巢进行生长，但是在生理期的时候这一部分的内膜并不会随着离开自己的，而是在卵巢的位置淤积，随着长在卵巢位置的内膜不断增厚，淤积的内膜会越来越多，使得卵巢的位置出现了囊肿。
四、如何预防卵巢巧克力囊肿
卵巢巧克力囊肿的病因尚未清楚，但与以人工流产为主的宫腔手术有着密切关系。因此，落实避孕措施，杜绝人工流产，有助于预防卵巢巧克力囊肿的发生。卵巢巧克力囊肿的治疗颇为棘手，所以，预防巧克力囊肿的发生就显得尤为重要。研究发现，卵巢巧克力囊肿的发生与早已进驻盆腔的异位子宫内膜有关。由此可见，预防卵巢巧克力囊肿的关键就在于如何避免子宫内膜异位症的发生。根据与子宫内膜异位症发病有关的“危险因素”，可从以下几方面采取预防措施：
1、注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。
2、要注意自身保暖，避免感寒着凉。
3、月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。
4、如已查出患有子宫内膜异位症，卵巢巧克力囊肿大于6cm以上者，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累，一旦囊腔内张力突然升高时，囊壁破裂，会形成急腹症。
5、尽量少做人工流产和刮宫，做好计划生育。
6、月经期要做好自身的保健，注意控制自己的情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌的改变。
7、女孩子青春期要避免受惊吓，以免导致闭经可形成溢流。
8、女性月经期一定要禁止性生活。
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