OR值的意义和计算公式 和95% CI

OR值的全称是oddratio,又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR值即是相对危险度的精确估计值。

计算公式如下：

Odd ratio, 95%CI

假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）:记为

odds 值在病例和对照可以计算如下：

病例Allele1Odds=A (A + B)/ B (A +B)=A/B

对照Allele1Odds=C (C + D) / D (C+ D)=C/D

那么在这一点Allele1的OR值可以计算如下：

Odds Ratio =(A / B)/(C /D) =AD/BC

同样的，95% Confidence Intervals (CIs)值可以计算如下：

95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(1/A+1/B+1/C+1/D)0.5

95% CI of OR = e95% CI ofln(OR)、

logistic回归中，OR值=1，表示该因素对疾病的发生不起作用

OR值大于1，表示该因素是一个危险因素

OR值小于1，表示该因素是一个保护因素

同时最好要算出它的95%CI

OR为比值比，也称优势比

当我们已知疾病的发生状况，比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时（即回顾性研究时），用OR进行定量描述。OR是否有意义还要看其P值，一般95%CI上限小于1时说明可能是保护因素，相反如果下限大于1则说明可能是危险因素。

ln(OR)近似服从正态分布，因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间，再计算OR置信区间（参考：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1127651/，http://bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf，http://www.sjsu.edu/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf）

参考资料1（维基）：/wiki/Odds_ratio#

定义：Definition interms of group-wise odds

Ifthe probabilities of the event in each of the groups arep1 (first group) andp2 (secondgroup), then the odds ratio is:

whereqx=1−px.An odds ratio of 1 indicates that the condition or event understudy is equally likely to occur in both groups.

参考资料2：/snp-tools-excel/

例子1：

例子2：

参考资料3：blackwell出版社

/specialarticles/jcn_10_268.pdf

参考资料4：http://intmedweb.wfubmc.edu/ebmreviews/odds.html

参考资料5：http://hydra.usc.edu/scehsc/pdfs/D-1-3-3lesson calculating odds.pdf

参考资料6：http://stanford.edu/class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf

参考资料7:/help/exact_tests_on_counts/gart.htm（介绍了OR和RR区别和联系）

博文来源于：/s/blog_4af3f0d0b9dh.html~type=v5_one&label=rela_nextarticle

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