虽然题中没有明确是什么性质的事业单位，但后面要逐渐分批参公，那么说明这个事业单位还是承担了一些行政管理职能，应该还是不错的。而你考上了另外一个单位的公务员，也没有明确这个是什么单位，这要我们来给你分析，那确实有点不切实际。虽然无法具体情况，具体分析，但从一般情况来看，个人建议你选择去考上的公务员单位，具体有以下几点原因：
第一，事业单位参公可能需要较长时间，而且单位会有变动。可以问问自己：现在的事业单位分批参公是已经确定了吗？全部完成要多久？你在第几批？这些你一定要搞清楚。如果是小道消息，那就根本不要考虑这个。即使是确定的，你也要明白自己是在哪一批，需要等待多长时间。即使是在第一批，在刚参公或者调整的单位，初期是比较混乱的。这很影响你的发展。虽然你可能在这个单位待了一段时间，有了一定的基础，比如说你跟领导、同事的关系较好，才能展现出来了等等，但在参公后很可能领导会变更，这样你就没有多大优势。
第二，你还年轻，可以尝试到新单位发展。从你考上公务员就可以看到你的年龄肯定并不大，至少不会超过35岁，一般都在30岁以下。年轻人可以尝试在新的公务员单位发展，而且以前在事业单位的工作经历，也可以作为在新单位发展的基础。而且如果这个公务员单位是个较大的机关或者较强势的部门，那么年轻人锻炼的机会很多，提拔也会很快。
第三，参公人员和公务员还是有些差别的。参公人员是指参照公务员法管理的事业编制人员，其虽然参照公务员法管理，在工资结构、适用职务与职级并行制度等上，基本与公务员相同，但其本质还是使用的是事业编制，以公务员的行政编制有所不同，在提拔晋升到公务员单位时，会比公务员提拔更难，毕竟编制性质改变，并且是上行。
综上所述，个人建议选择去公务员单位较好，早去早落袋为安。
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