首先，相比于CT和MRI，X线检查有着明显的价格优势。其次，相对于CT来说，X线检查辐射量较小。最重要的是，在腰椎间盘突出的早期诊断中，腰椎侧位、立位片（即x光片子）有着重大作用。在早期诊断中，通过X线片子，能够观察患者的腰椎是否有生理性弯曲、腰椎间隙是否有变化、椎体周边是否形成骨刺。临床上单纯腰痛的患者，仍然是大多数。对于这些患者来说，X线检查是性价比最高的检查。
在腰椎核磁共振的扫描中，能够观察到椎间盘的脱出、突出、膨出、变形等不同时期的病理变化，还可以通过多节段连续成像、三维切面，观察突出物和后纵韧带、纤维环、椎间盘、脊髓、马尾神经、椎弓之间的关系。尤其是硬膜囊神经根和突出物的关系，由此推断出髓核的变化，以及周围组织粘连、出血、水肿等结构上的变化。
虽然MRI扫描的时间较长，价格在三项检查中价格最高，但没有放射性，具有较高的安全性。而且能够通过全方位、多序列成像，更好的观察病变位置的状况，还能清晰的观察到软组织的状况，避免腰椎结构有叠影，以便提高诊断的准确率。不过，受检查仪器的局限，身体内带有金属的患者、患有幽闭恐惧症的患者，均不适合进行核磁共振检查。
CT也是临床中多种疾病诊断的常用影像学检查方式，具有扫描区域广、速度快、费用低的特点，是很多腰椎间盘突出患者首选的诊断方式。
CT能够清晰显示椎体情况、腰椎间隙内部情况，以便掌握脊髓内是否存在肿瘤、结核等病症，还有助于对腰骶椎后位、斜位状况进行评定，另外在腰椎间盘突出钙化和积气等方面有着较高的灵敏度，能显示周围组织和病变髓核之间的关系，对神经根受压情况的诊断有重要意义。
CT检查也存在着一定的不足之处，如仪器种类较多，不同的仪器在扫描技术方面存在较大差异，诊断的误差较大，对影像学医师的要求也更高。对严重脊柱畸形、先天性椎管狭窄及椎管术后、椎间盘游离、椎间盘钙化等方面效CT诊断有一定困难。而且CT存在一定的放射性。
MRI和CT两种检查方式在腰椎间盘突出的诊断中均有着各自的优势，MRI在椎间盘变性、变形等方面诊出率较高，而CT在髓核钙化、韧带钙化、骨质增生等方面灵敏性较高。
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