大蒜是民间常用于治疗腹泻的偏方和验方。历代本草言大蒜气味辛温，能杀毒气。我国很早就运用大蒜治胃肠病了，如东汉名医华佗曾用蒜齑（即切碎的大蒜子）与醋治疗腹中蛔虫；唐代医学家孙思邈又用大蒜治疗泄泻暴痢；宋代本草家用它杀毒气，健脾胃；明代李时珍则用大蒜治疗霍乱和冷痢。古人还主张将大蒜作为旅游时的必备药物，如元代王祯在《农书》中说，将大蒜“携之旅途，则炎风瘴雨不能加，食之腊毒不能害”。实际上就是运用大蒜作为消毒杀菌的良药，以便有效地预防胃肠病。
大蒜作为偏方，至今亦常用于治疗胃肠炎及痢疾之类的疾病，如用生大蒜捣碎敷贴两足心，也可贴脐中，除痢止泻有良效。又如治小儿腹泻，可取带皮大蒜两头，先加以烧烤，待皮焦黑、肉软熟时服食，此时大蒜已无辛辣味，小孩能够接受，服后即可止泻，如服一次无效或效果欠佳则可多服几次。用此法治疗成年人腹泻亦有一定效果。不过应当指出，大蒜生用比熟用效果好，成年人仍应以生吃大蒜为佳。
大蒜含有蒜辣素，这是一种强力植物杀菌素，具有特别的刺激性气味，对肠道致病菌如痢疾杆菌、伤寒杆菌等均有很强的抑制作用，故用来治疗胃肠炎及腹泻很有效。但是用大蒜治疗胃肠炎及腹泻时应当注意如下两点：一是凡胃肠患有溃疡或出血性疾病者，不可使用大蒜，以防因其刺激性太大而产生副作用；二是所用大蒜必须是新鲜、优质而没有腐烂的，收藏时间过久的陈年大蒜由于所含蒜辣素挥发较多而效果较差。最好是挑选当年所产新鲜大蒜特别是独头大蒜，其功效将更为显著。
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