在R语言中进行Fisher精确检验
Fisher精确检验是一种常用的非参数统计方法,用于比较两个分类变量之间的关联性。它被广泛应用于医学研究、遗传学和生态学等领域。本文将介绍如何在R语言中进行Fisher精确检验,并提供相应的源代码示例。
首先,我们需要准备数据。假设我们有一个2x2的列联表,其中包含两个分类变量的观测值。下面是一个示例数据集:
# 创建示例数据集data <- matrix(c(10, 5, 15, 20), nrow = 2, ncol = 2)colnames(data) <- c("Group1", "Group2")rownames(data) <- c("Outcome1", "Outcome2")# 显示数据集data
在这个示例数据集中,"Group1"和"Group2"是两个分类变量的不同水平,"Outcome1"和"Outcome2"是两个分类变量的不同结果。你可以根据你的实际数据进行相应的修改。
接下来,我们可以使用R中的fisher.test()
函数执行Fisher精确检验。该函数接受一个2x2的列联表作为输入,并返回Fisher精确检验的结果。
# 执行Fisher精确检验result <- fisher.test(data)# 显示检验结果result
执行以上代码后,会输出Fisher精确检验的结果,包括p值和置信区间等信息。
如果你只对p值感兴趣,可以使用以下代码提取p值:
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