R语言临床预测模型的性能评估与验证方法实战:自定义净重新分类指数NRI函数
介绍
临床预测模型的评估是衡量模型性能和可靠性的重要环节。在R语言中,我们可以利用各种指标来评估和验证预测模型。本文将介绍一种自定义的净重新分类指数(NRI)函数,用于评估临床预测模型的性能。
净重新分类指数(Net Reclassification Improvement,NRI)是一种常用的评价指标,用于比较两个模型的分类准确性改进程度。它可以衡量一个新模型相对于基准模型在正确分类和错误分类上的改进情况。NRI的计算方法较为复杂,但我们可以通过自定义函数来简化实现过程。
下面将介绍如何使用R语言自定义的NRI函数来评估临床预测模型,并给出相应的源代码。
数据准备
首先,我们需要准备用于评估的数据集。在这个示例中,我们使用一个虚构的临床数据集,其中包含了一些预测变量和目标变量。
# 创建虚构的临床数据集set.seed(123)n <- 1000x1 <- rnorm(n)x2 <- rnorm(n)x3 <- rnorm(n)y <- factor(sample(c(0, 1), n, replace = TRUE))data <- data.frame(x1, x2, x3, y)
模型构建与评估
接下来,我们使用Logistic回归模型作为临床预测模型,并使用交叉验证的方法进行模型评估。
# 定义交叉验证函数cross_validation <- function(data, model, folds = 5) {indices <- sample(1:folds, nrow(
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