茄子菌核病的防治方法包括农业防治，生物防治和化学防治。
茄子菌核病防治：合理轮作，清除菌源，用菌核净叶面喷雾加以防治。
（1）塑料棚内栽培茄子覆地膜可阻止子囊盘出土，减少菌源。（2）药剂处理土壤，每亩用50%多菌灵可湿性粉剂4~5公斤，对干土适量充分混匀撒于畦面，然后耙入土中。可减少初侵染源。（3）注意通风以降低棚内湿度，寒流侵袭时要注意加温防寒以防植株受冻，诱发染病。（4）发现病株及时拔除，带到棚外消毁。（5）药剂防治：田间始见于囊盘或发现中心病株后，轮换或交替使用，隔10~15天1次，连续防治3~4次。此外保护地也可选用烟雾法或粉尘法。
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