一、药物治疗
分常规西药治疗和经络疏通法特殊中药治疗
(1)水杨酸类：柳氮磺胺吡啶和5-氨基水杨酸(5-ASA)适用于慢性期和轻、中度活动期病人。一般认为SASP不能预防克罗恩病复发。对不能耐受SASP或过敏者可改用5-ASA。对直肠和乙状、降结肠病变可采用SASP或5-ASA制剂灌肠，经肛门用药。
注意事项：由于其有分解物对肝脏有损，因此服用该类药物的患者最好不要同时服用抗生素，并每月定期检查肝功能。严重肝、肾疾患、婴幼儿、出血性体质以及对水杨酸制剂过敏者不宜应用SASP及5-ASA制剂。
(2)肾上腺皮质激素：常用于中、重症或暴发型患者，对不能耐受口服者，可静滴氢化可的松或甲基强的松龙或ACTH，14天后改口服泼尼松维持。采用隔日口服泼尼松或合用SASP或s-ASa作为维持治疗。对直、乙结、降结肠病变可采用药物保留灌肠，如氢化可的松唬珀酸盐、0.5%普鲁卡因，加生理盐水，缓慢直肠滴入，也可与SASP,s-ASA或锡类散等药物合并使用，妊娠期也可应用。
激素注意事项：由于激素的副作用较大，通常在急性发作控制后尽快停用。
(3)其他药物：对肾上腺皮质激素或磺胺药治疗无效者，可改用或加用硫唑嘌呤、6-琉嘌呤(6MP)、环孢素、FK506等其他免疫抑制剂，也可合用左旋咪唑、干扰素、转移因子、卡介苗及免疫球蛋白等免疫增强剂。此外，甲硝唑(灭滴灵)、广谱抗生素和单克隆抗体等也可应用。
在此特别提出：对于单抗(如类克)万不得以不建议使用，临床总结长期使用此药物，前期自我感觉良好，但复发是必然的，那时会给以后的正确治疗带来相当大的难度。
二、经络疏通法治疗方法
主要以调整人体温凉平衡，疏通经络堵塞为目的。以药物归经，中药外用为主，临床实践证明：药物通过经络感传要比口服吸收效果更快速。
主要治疗方法有：
A、药浴下肢上肢
B、15经脉推拿、脏腑推拿
C、贴药擦药
D、肛门灌肠用药
E、重度患者配合口服。
F、特重患者给予营养治疗。肠内营养，肠外营养和膳食营养综合治疗。
详情见：经络疏通法六大疗法
三、外科手术
克罗恩病手术治疗用于完全性肠梗阻、肠瘘与脓肿形成、急性穿孔或不能控制的大出血，以及难以排除癌肿的患者。对肠梗阻要区分炎症活动引起的功能性痉挛与纤维狭窄引起的机械梗阻，前者经禁食、积极内科治疗多可缓解而不需手术，对没有合并脓肿形成的瘘管，积极内科保守治疗有时亦可闭合，合并脓肿形成或内科治疗失败的瘘管才是手术的指征。手术方式主要是病变肠段的切除，手术切除包括病变及距离病变远、近侧10cm的肠段及其系膜和淋巴结。如局部粘连严重或脓肿形成，不能切除，可作短路或旷置术，根据情况再作二期病变肠管切除术。如为腹腔内脓肿则切开引流。对多处病变的病例，只切除有并发症的病变肠管，避免因过度切除发生短肠综合征。因误诊为阑尾炎等而在手术中发现为此病时，如无肠梗阻、穿孔等并发症，不必做肠切除术。本病手术治疗后多在肠吻合口附近复发。推荐的预防性用药在术后2周开始，持续时间不少于3年。术后复发率高，应随访。
预后：
Crohn病病死率为5%～10%;手术病死率为4%。其死亡原因，多数是由于腹腔内感染、脓肿、腹膜炎、肠瘘等并发症、慢性消耗衰竭以及癌变等引起。
本病有自行缓解的可能，尤其是轻、中型者。据报道安慰剂对照研究，随诊4个月自行缓解率为30%;1年、2年病情稳定者分别为20%和10%。在缓解的病人中，继续应用安慰剂，其1年和2年后病情仍稳定者分别为70%和50%。因此，在评价药物疗效时，应考虑本病自行缓解的因素。但需强调为较好地控制和稳定病情药物治疗的作用绝不可忽视。
Crohn病经内、外科治疗，多数病人虽可获得病情缓解和稳定并有较好的生活质量和健康状况，切除病变组(经长期随诊，临床痊愈和症状改善者占73.2%)，但均有较高的复发率(总复发率在50%以上)。手术治疗者，术后每年复发率8%～10%。但应指出，影响病变复发的因素较多，仍需进一步探讨。在复发率的统计上，采用的检查方法和确诊标准，亦有明显的影响。诸如：①以内镜检查为标准，其复发率术后1年和3年分别为70%和85%;②以临床症状、X线检查、内镜或病理为标准，其术后2、3、4年复发率分别为20%、30%和40%～50%;③以需行再手术为标准，术后5年复发率为25%～30%，术后为40%～50%。
本病是一个慢性疾病，病变可呈进行性发展或反复急性发作。对其处理，可能需多次手术。据报道，第1次手术后需行第2次手术者为45%;第2次术后需行第3次手术者为25%。病变位于末段回肠，随诊约30%需行多于一次肠管切除术;约5%需行3次以上肠管切除术。多次手术，尤其是多次肠管切除术后，约有1.5%者发生短肠综合征，处理颇为棘手，是仍需继续研究和解决的课题。
本病癌变发生率较高，与普通人群比较回肠和大肠癌发生率高出90～100倍;Crohn病人发生会阴、肛管鳞癌，Hodgkin’s disease和Non-Hodgkin’s lymphoma等也较多。行短路和旷置术后，有5.3%发生肠癌在旷置肠袢内。腺癌是最常见的类型，较多见于年轻人。癌变通常都发生在有长期病史者。Crohn病起病距发生癌变平均时间为27年;距短路手术时间为。迄今为止，已报道Crohn病小肠癌变约100例。虽病例不多，但其癌变无明显特异性症状，发现较晚，预后差，应提高警惕并作必要的检查，及早诊断，及时处理。
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