是不会自动扣除的，需要自己去社保部门办理自动扣缴费用才能自动扣除，没有办理是不会自动扣的。
社会保障卡，有两大保障账户: 一个是养老保险账户，另一个是医疗保险账户。
不知题主指的是这两个账户吗还是其中一个。如果想要这两个账户都自动扣缴，需要分别去社会保障部门和医疗保险主管部门办理自动扣缴费用。
因为养老保险和医疗保险这两项费用缴费时间不同，需要自己注意在缴费时保证自己的社会保障卡银行账户里有足够金额，才能保证扣款成功。
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