1、时要细心检查菌枝和菌棒。杂菌喜腐生生活，应选用未腐朽、无霉菌的新鲜木材培养菌棒，并尽可能缩短培养时间。如果发现菌棒上有杂菌，轻者刮掉，晒1-2日；重者废弃。
2、检查所用麻种。如发现感染霉菌，轻者刮去、日晒，或用75%酒精、多菌灵等局部消毒后使用。凡碰伤、霉烂的麻种都要废弃。
3、填充物要填实，切不可留有空隙。加强温、湿、气的管理，控制穴内湿度，保持干燥环境，就可以减少霉菌发生。
4、天麻穴不宜过大、过深。利用菌棒数量较少的菌麻栽培、是防止杂菌感染的一种最好的栽培方法。
5、加大蜜环菌的用量。菌枝或菌种放得多，菌长得快，就能抑制其他杂菌生长。
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